大多数分析和小规模制备生物大分子首选是台式冷冻水平转子离心机，它能产生强大的离心力，生物大分子在水平转子的离心管中有较长的沉降路径，壁效应较小，可使生物大分子获得精确分离。为获得最佳分辨率，样品体积不应超过梯度体积的3%，梯度上的样品区带应该非常窄。

离心管尺寸和转速不同，分离效果不同。小剂量样品可用细长型离心管，大容量样品可用粗短型离心管，它们都可使样品区带尽可能窄。然而，为了提高分辨率一味增加生物大分子的沉降路径，会使离心时间延长。在此过程中，有些蛋白质会失去活性。随着沉降时间的延长引起的扩散，会导致区带变宽。

 

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