气液填充柱色谱仪固定液按化学结构可分为烃类、硅氧烷类、醇类和酯类等。
一、烃类：
是非极性固定液，包括烷烃和芳烃。常用的有角鲨烷（相对极性定为零）、石蜡烷和聚乙烯等。
二、硅氧烷类：
是通用型固定液，从弱极性到极性都有，种类多，使用温度较高，溶解能力强，使用范围广。
1、聚二甲基硅氧烷类：
目前使用最广泛的固定液，可使用温度范围大，对一般的有机化合物有较好的溶解能力。
常用的固定液有：SE-30、OV-1、OV-101、SP2100、SF-96、DC-200和UCW982等。
2、聚苯基甲基硅氧烷类：
由于硅原子上引入了苯基，与甲基硅酮相比较，芳香化合物的溶解度升高，极性组分保留值增大。
适合分离甾体化合物、生物碱、醇类和糖类等化合物。
按苯基含量不同可分为三类：
（1）低苯基聚硅氧烷类（苯基含量＜20%）：如OV-3、OV-7、HP-5和SE-52等。
（2）中苯基聚硅氧烷类（苯基含量20%～50%）：如OV-17和DC-550等。
（3）高苯基聚硅氧烷类（苯基含量＞50%）：如OV-22和OV-25等。
3、氟烷基聚硅氧烷类：
是中等极性固定液，给质子能力很强，对硝基化合物和酮类有显著的选择性保留，对芳烃和醇类则否。
比较常用的是QF-1。
4、氰烷基聚硅氧烷类：
是极性较强的固定液，由于含有电负性的氰基，对极性组分有较强的定向力，对含芳香基和烯基化合物保留较强。
适合从复杂的烃类混合物中分离不饱和烃与芳烃，适合分离不饱和脂肪酸，适合分离糖类、醇类、酚类、甾体化合物和脂肪酸等。
比较常用的是OV-225。
三、醇类：
是氢键型固定液，分非聚合醇类与聚合醇类。
聚乙二醇类的相对极性为++++，适合分离醇类、醛类、脂肪酸类、酚类、生物碱类、酯类等化合物。
最常用的是PEG-20M，药物分析中最常用的气相色谱仪固定液。
四、酯类：
是中强极性固定液，分非聚合酯类与聚合酯类。
1、非聚合酯类：常用的有邻苯二甲酸酯，如DNP，是分析低沸点化合物最常用的固定液之一。
2、聚合酯类：常用的有线性脂肪族聚酯，如DEGS，适合分离醇类、酚类、脂肪酸类、酯类和胺类等化合物。
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