色谱仪的分离效能指标有分配系数、分配比、峰高分离度、分离度、理论塔板数、理论塔板高度、有效塔板数、有效塔板高度和柱效率等。
一、分配系数K：
在一定温度和压力下，组分在固定相和流动相之间的分配达到平衡时的浓度之比称为分配系数K。
一定温度下，组分的分配系数K越大，出峰越慢。
样品一定时，分配系数K主要取决于固定相性质。
每个组分在各种固定相上的分配系数K不同。
选择适宜的固定相可改善分离效果。
样品中各组分具有不同的K值是分离的基础。
某组分的K = 0时，不被固定相保留，最先流出。
二、分配比k：
在一定温度和压力下，组分在固定相和流动相之间的分配达到平衡时，组分分配在固定相和流动相中的质量之比称为分配比k，又称容量因子。
分配比k是衡量色谱柱对分离组分保留能力的重要参数。
三、峰高分离度θ：
θ =（hi－hm)/hi
式中：hi为小峰的峰高，hm为峰谷的高度。
要求θ值大于0.5。
四、分离度或分辨率R：
R = 2（tR2－tR1）/（W1+W2）
式中：tR为组分的保留时间，W为组分的色谱峰宽。
1、R = 0.8：相邻两峰的分离程度达89%
2、R = 1：相邻两峰的分离程度达98%
3、R = 1.5：相邻两峰的分离程度达99.7%
4、R > 1.5：相邻两峰的基线分离，相邻两峰完全分离。
五、理论塔板数n：
n = 16（tR/W）2
式中：tR为组分的保留时间，W为组分的色谱峰宽。
理论塔板数表达了色谱峰的扩张程度和陡度，但难以说明色谱柱的选择性。
六、理论塔板高度H：
H = L/n
式中：L为色谱柱长，n为色谱柱的理论塔板数。
七、有效塔板数n有效：
n有效 = 16（tR′/W）2
式中：tR′为组分的调整保留时间，W为组分的色谱峰宽。
八、有效塔板高度H有效：
H有效 = L/n有效
式中：L为色谱柱长，n有效为色谱柱的有效塔板数。
九、柱效率：
色谱分离过程中的动力学因素决定的色谱分离效率称为柱效率，又称柱效能。柱效率通常用理论塔板高度和理论塔板数表示。
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